苹果属种质TP-M13-SSR亲缘关系及遗传多样性分析

• 作者: 侯丽媛 张春芬 曹秋芬 李亚莉 王育川 聂园军 肖蓉 董艳辉 赵菁 邓舒
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 苹果属 种质资源 指纹图谱 亲缘关系 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1371-1378,1522
• 页数: 9页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.09.02

摘要

利用TP-M13-SSR技术对供试材料进行指纹图谱构建,在此基础上采用GenAlEx 6.501软件对供试材料进行亲缘关系和遗传多样性分析,利用Ntsys软件基于Jaccard系数进行了UPGMA聚类分析.结果 显示,16对TP-M 13-SSR引物共检测到180个等位基因位点,每个SSR位点检测到的等位基因数从3个(BGT23b、KA4b)到21个(CH01f07a)不等,扩增片段长度大小范围主要在104～245 bp,平均等位基因数为11.25个;有效等位基因数从1.129个(BGT23b)到10.776个(CH04g07),平均有效等位基因数为5.38个;观测杂合度从BGT23b的0.040到CH04g07的0.096,平均值为0.741,期望杂合度值从BGT23b的0.114到CH01f07a的0.907,平均值为0.742,无偏杂合度期望值从BGT23b的0.117到CH01f07a的0.926,平均值为0.758;Shannon's指数平均为1.827;固定指数平均为0.036.TP-M13-SSR分析结果与已知苹果属间的谱系较为一致.