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摘要:
目的:预测三七主要活性成分治疗肝细胞癌的作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选三七的主要活性成分,并利用SEA数据库预测上述成分的潜在作用靶点;从人类基因组注释(Genecards)数据库获得肝细胞癌相关靶点;利用Venn软件对两者取交集获得三七治疗肝细胞癌的作用靶点.使用Cytoscape3.7.1软件构建有效成分-靶点网络.应用R语言软件包clusterProfiler对上述靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)与代谢通路(metabolic pathway,KEGG)富集分析.结合BioGrid、InWeb_IM、OmniPath数据库构建靶点蛋白相互作用(target protein interaction,PPI),由Cytoscape软件进行可视化并进行网络拓扑分析以获得核心靶点.利用SYBYL-X2软件对核心靶点和对应活性成分进行分子对接验证结合强度.结果:共获得槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、人参皂苷rh2等7个主要活性成分,可作用于肝细胞癌相关的32个靶点;这些靶点显著富集于核受体活性、转录因子活性,直接配体调节序列特异性DNA结合、类固醇激素受体活性、癌症中的蛋白多糖、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药等多个GO和KEGG条目.结论:三七治疗肝细胞癌作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,为三七有效成分的筛选及深入研究提供一定科学依据.
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文献信息
篇名 基于网络药理学分析三七治疗肝细胞癌的作用机制
来源期刊 中医学报 学科 医学
关键词 三七 肝细胞癌 网络药理学 靶点 基因本体论 富集分析 药物作用机制
年,卷(期) 2020,(4) 所属期刊栏目 方药研究
研究方向 页码范围 848-852
页数 5页 分类号 R273.357
字数 语种 中文
DOI 10.16368/j.issn.1674-8999.2020.04.189
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陆地 33 91 5.0 7.0
2 孙文静 4 3 1.0 1.0
3 安景铄 2 1 1.0 1.0
4 王樱博 2 1 1.0 1.0
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中医学报
月刊
1674-8999
41-1411/R
大16开
河南省郑州市金水路1号
36-153
1985
chi
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