甲状腺癌中miR-222关键靶基因预测及其信号通路分析

• 作者: 张菁 郑琳琳 黄琪峰
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: 甲状腺癌 miR-222 AGTR1 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 85-88
• 页数: 4页
• 分类号: R736.1
• 字数: 2833字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2020.01.026

摘要

目的 利用生物信息学技术预测人类miR-222的靶基因,并分析其可能参与甲状腺癌的生物学过程和信号通路.方法通过TCGA数据库研究miR-222的表达与甲状腺癌的关系,然后TCGA中表达下调的基因和网站预测的miR-222靶基因进行取交集得到重叠基因,再进行生物信息学分析确定与甲状腺癌相关的关键miR-222靶基因和通路,最后通过GEPIA对靶基因进行表达验证以及miR-222和靶基因的相关性分析.结果 miR-222在甲状腺癌中表达上调,富集分析表明miR-222很有可能参与血管紧张素受体-配体结合的调节,其中一个可能的靶基因是AGTR1,其在甲状腺癌中表达下调,与miR-222的表达呈负相关.结论 上调的miR-222可能以AGTR1为靶标,从而调节甲状腺癌中血管紧张素受体-配体结合发挥作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张菁	浙江大学医学院附属邵逸夫医院药学部	14	43	3.0	6.0
2	黄琪峰	浙江大学医学院附属邵逸夫医院药学部	3	0	0.0	0.0
3	郑琳琳	浙江大学医学院附属邵逸夫医院超声科	3	0	0.0	0.0