人脑多形性胶质母细胞瘤的综合基因组分析明确核受体辅激活因子4的预后价值及相关作用机制

• 作者: 张少校 李智
• 来源期刊: 中国医学创新
• 关键词: 核受体辅激活因子4 生物信息学 多形性胶质母细胞瘤
• 年，卷（期）: 2020,（17）
• 所属期刊栏目: 经验交流
• 页码范围: 156-160
• 页数: 5页
• 字数: 3310字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-4985.2020.17.038

摘要

目的:利用生物信息学方法研究核受体辅激活因子4(NCOA4)表达与人脑多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)患者总生存时间的关系并探讨其潜在机制.方法:将来源于癌症基因组图谱(TCGA)的152例GBM患者先按三等分法分为NCOA4高、中、低表达组(n=51、50、51),再按最佳界值法分为NCOA4高表达组(n=29)与低表达组(n=123),比较各组生存时间.将来源于人类肿瘤相关基因表达汇编(GEO)数据库的GSE7696数据集的70例GBM患者按三等分法分为NCOA4高、中、低表达组(n=23、24、23).比较各组生存时间,分析影响GBM患者术后独立预后因素.基于TCGA中GBM患者的level 3 RNASeqV2基因组数据进行基因集富集分析确定NCOA4在GBM中发挥作用的关键机制.结果:TCGA数据库中根据三等分法分组的NCOA4高表达组中位生存时间明显长于NCOA4中、低表达组(P=0.005);根据最佳界值法分组的NCOA4高表达组中位生存时间明显长于低表达组(P<0.001).GSE7696数据集中NCOA4高表达组中位生存时间明显长于NCOA4中、低表达组(P=0.022).NCOA4表达水平为影响术后GBM患者的独立预后因素(P=0.041).在GBM中发挥作用的关键是溶酶体、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、趋化因子和Toll样受体相关的信号通路.结论:NCOA4表达增高是预测术后GBM患者预后良好的独立因素,而溶酶体、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、趋化因子和Toll样受体作用的增强可能是NCOA4在GBM中影响预后的重要作用机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李智		91	554	14.0	20.0
2	张少校		4	14	2.0	3.0