2017-2018年北京市东城区新甲型H1N1流感病毒HA基因特征研究

• 作者: 李艳宇 李姗姗 杜嘉鑫 高鹏
• 来源期刊: 职业与健康
• 学科: 医学
• 关键词: 新甲型H1N1流感病毒 HA基因 鸡胚株 序列分析 进化树
• 年，卷（期）: 2020,（20）
• 所属期刊栏目: 流行病学与预防保健
• 页码范围: 2834-2838
• 页数: 5页
• 分类号: R446.7
• 语种: 中文

摘要

目的 了解2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区新甲型H1N1流感病毒流行特征,并分析细胞株和鸡胚株血凝素(HA)基因遗传变异情况.方法 收集2017年4月1日-2018年3月31日期间北京市东城区流感数据,分析新甲型H1N1流感的流行特征;用实时荧光PCR(RT-PCR)方法 对选取的7株新甲型H1N1细胞分离株和其相对应的7株鸡胚株进行HA基因序列扩增并测序,用DNASTAR 5.0和MEGA 6.0软件对测序结果 进行系统进化树和遗传特征分析.结果 2017年4月1日-2018年3月31日期间在北京市东城区共检测样本1 780份,新甲型H1N1阳性99份,阳性率是5.56％,细胞分离出新甲型H1N1为51株,鸡胚株为15株.测序成功的13株毒株与世界卫生组织(WHO)推荐的北半球疫苗株A/Michigan/45/2015(甲型/密歇根/45/2015)在系统进化树上位于同一大分支上,同源性较高.其核苷酸同源性为98.96％～100.00％,氨基酸同源性为97.92％～100.00％.其中S74R、P137S、S164T、S183P、T185N、T216K、I267T共7个氨基酸位点(包含抗原决定簇位点)发生改变,决定流感毒力的D222位点和二硫键未发生改变.结论 目前北京市东城区新甲型H1N1流感病毒与疫苗株匹配性较高,但是其HA序列中氨基酸位点变异仍存在,要长期从分子水平进行监测,预防新甲型H1N1流感发生大流行.