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甘蓝型油菜扩展蛋白家族的全基因组鉴定及其对缺硼胁迫响应的差异分析
甘蓝型油菜扩展蛋白家族的全基因组鉴定及其对缺硼胁迫响应的差异分析
作者:
吴涛
曾妮
李巍
汪社亮
徐芳森
石磊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
扩展蛋白
甘蓝型油菜
硼
转录响应
缺硼
摘要:
以甘蓝型油菜(Brassica napus L.)硼高效品种'青油10号'和硼低效品种'Westar 10'为研究对象,采用生物信息学分析、转录组测序和实时荧光定量PCR技术,鉴定其基因组中扩展蛋白的家族成员,并对该基因家族响应缺硼胁迫的表达差异进行分析.结果显示,甘蓝型油菜基因组中包含109个扩展蛋白,可分为4个亚家族,包括:79个扩展蛋白A(BnaEXPAs)、21个扩展蛋白B(BnaEXPBs)、5个类扩展蛋白A(BnaEXLAs)和4个类扩展蛋白B(BnaEXLBs).同一亚家族中的扩展蛋白具有相对保守的基因结构和蛋白质基序组成.这些扩展蛋白基因分布在19条染色体上,其中10个位于硼高效QTL区间内.转录组测序分析结果表明,缺硼胁迫时'青油10号'的根、幼叶和老叶中分别有40、18和30个扩展蛋白基因显著上调或下调表达;而'Westar10'中分别有27、24和41个扩展蛋白基因显著上调或下调表达.其中'青油10号'根中的BnaC04.EXPA6a,幼叶中的BnaA09.EXPA5以及老叶中的BnaA09.EXPA16、BnaC04.EXPA3、BnaCnn.EXPA5b和BnaA03.EXPA8基因的表达水平均显著高于'Westar10'.研究结果说明甘蓝型油菜基因组中扩展蛋白基因家族数量庞大,其中高、低效品种间和不同硼水平中差异表达的扩展蛋白可能在甘蓝型油菜低硼适应性中发挥重要作用.
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篇名
甘蓝型油菜扩展蛋白家族的全基因组鉴定及其对缺硼胁迫响应的差异分析
来源期刊
植物科学学报
学科
生物学
关键词
扩展蛋白
甘蓝型油菜
硼
转录响应
缺硼
年,卷(期)
2021,(1)
所属期刊栏目
遗传与育种
研究方向
页码范围
59-75
页数
17页
分类号
Q943.2
字数
语种
中文
DOI
10.11913/PSJ.2095-0837.2021.10059
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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植物科学学报
主办单位:
中国科学院武汉植物园
湖北省植物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
2095-0837
CN:
42-1817/Q
开本:
大16开
出版地:
武汉市74006信箱
邮发代号:
38-103
创刊时间:
1983
语种:
chi
出版文献量(篇)
2461
总下载数(次)
2
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