甘蓝型油菜HMG基因家族的生物信息学分析

• 作者: 丁洪玲 冯书燕 宋小明 李春金 李野默 杨启航 王彤 王秋梅 胡静静 裴巧英 郭媛媛
• 来源期刊: 中国油料作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝型油菜 HMG基因家族 系统进化 染色体定位 直系同源基因 旁系同源基因 基因表达
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 318-325
• 页数: 8页
• 分类号: S565.403
• 字数: 4148字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7505/j.issn.1007-9084.2018.03.002

摘要

为研究甘蓝型油菜HMG(high mobility group)基因家族的起源、进化和功能,利用生物信息学方法对甘蓝型油菜和其近缘物种HMG基因家族进行鉴定,并对其进化、基因结构、组织表达、直系旁系同源基因进行系统分析.在甘蓝型油菜中鉴定到45个HMG家族成员,并根据进化树和基因结构将其分成5组.染色体定位发现,19条染色体中有18条染色体有HMG基因,说明该家族基因分布较广泛.在甘蓝型油菜与甘蓝、白菜和拟南芥分别鉴定到45、47和26个直系同源基因对.在甘蓝型油菜中鉴定到28个旁系同源基因对,而在其它3个物种中则比较少,这可能与甘蓝型油菜的多次基因组加倍有关.对45个甘蓝型油菜BnHMG基因在根和叶中的表达模式进行分析,结果显示,大多数基因在根和叶中均有表达,且呈现出不同的表达模式.