基于数据库的未分化甲状腺癌基因组变异分析及靶向药物筛选

• 作者: 王耀坤 陈珏晓 张明远 邵长利 杨玉 商宇
• 来源期刊: 癌变·畸变·突变
• 学科: 医学
• 关键词: 未分化甲状腺癌 靶向药物 cBioPortal数据库 TP53
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 53-57
• 页数: 5页
• 分类号: R736.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-616x.2021.01.011

摘要

目的:对未分化甲状腺癌的基因组变异情况进行分析并以此为基础筛选候选靶向药物.方法:通过cBioPortal数据库获得患者样本数据,筛选同时发生突变与拷贝数变异的基因,计算其遗传变异频率.绘制生存曲线以筛选与患者生存率关系密切的基因变异.利用STRING数据库分析蛋白质相互作用并进行GO功能富集分析,利用CARE软件筛选潜在的靶向药物.结果:TP53、PI3KCA、ARID2是未分化甲状腺癌遗传变异频率最高的基因.TP53基因的错义突变与患者生存率下降有关.GO功能富集分析发现P53通过调控DNA损伤修复、细胞周期阻滞等生物学过程参与未分化甲状腺癌的发生.对于携带TP53错义突变的患者,索拉非尼、鲁索替尼等药物具有高反应性,而普纳替尼等药物具有耐药性.结论:TP53基因错义突变是影响未分化甲状腺癌患者预后的关键基因变异,而索拉非尼、鲁索替尼等药物是携带TP53基因错义突变患者的候选靶向药物.