获取生物物种名录信息的R程序包SP2000

• 作者: 丁刘勇 李昊 陶捐 张金龙 黄敏睿 杨科 王军 丁城志 何大明
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 物种名录 红色名录 中国生物多样性 R语言程序包
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 118-122
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2020235

摘要

物种名录为衡量区域和全球生物多样性提供了数据基础.随着互联网的兴起与发展,人们将地球上己知的动物、植物、微生物等类群的物种名录信息存储到公共数据平台中,并对物种名录进行快速及时地更新,这极大地促进了分类学、保护生物学和宏观生态学等学科的发展,成为政府或国际组织开展物种保育现状评估、红色名录编撰和生物多样性保护的重要依据.物种2000中国节点(http://www.sp2000.org.cn)和Catalogue of Life网站(http://www.catalogueoflife.org)分别是中国和全球最大的生物物种名录数据平台,截至2020年6月4日,其收录的物种数分别为122,280种和1,829,672种.然而这些数据平台仅提供物种查询、检索、下载等基本功能,难以满足使用者准确、快速地批量获取所需生物物种名录数据信息的需求,制约了这些大数据平台在生物多样性研究和保护中的作用.因此,我们选取R语言开发了程序包SP2000,旨在帮助用户批量获取中国或全球生物物种名录信息.该程序包具有跨Windows、MacOS、Linux等多个系统运行、操作便捷、代码开源等特点.为了方便用户使用,本文详细介绍了SP2000的基本原理、特点及使用指南,包括程序包的下载、安装、运行和参数设置等.