基于先验算法的AD基因与影像的关联研究

• 作者: 高岳 李金 刘文杰 曹洛龙 梁洪
• 来源期刊: 生命科学仪器
• 关键词: 阿尔兹海默病 先验算法 频繁项集 全基因组关联研究
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与应用|Technology and Application
• 页码范围: 61-66
• 页数: 6页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.11967/2021190409

摘要

阿尔兹海默病(Alzheimer's disease,AD)已成为导致死亡的主要原因之一.AD的早期诊断和干预成为大多数研究关注的焦点.本文针对多个SNP的相互关联,将影像表型和基因变异之间进行关联研究.首先处理ADNI-GO/2期的基因分型数据,提取位于24个AD候选基因中±20Kbp的SNPs;其次处理1515名参与者的MRI图像,得到1515个182×218×182的voxel影像数据,对获得的voxel影像数据进行降维处理,得到1515个61×73×61大小的数据;最后综合SNP数据与voxel数据,进行vGWAS(voxel Genome-Wide Association Study)分析.将关联分析结果应用频繁项集挖掘算法中的先验算法,得到满足覆盖率40％的具有遗传效应且区域覆盖率最大的SNP集合{rs6092321,rs7806,rs386274},本文揭示多个SNP在脑功能结构中的交互作用,对阿尔兹海默症早期诊断有重要意义.