基于网络药理学探讨潜阳封髓丹治疗慢性阻塞性肺疾病的潜在分子机制

• 作者: 于海洋 陈云志 朱星 刘怀全 赵洁 张旭飞 李文
• 来源期刊: 湖北民族大学学报（医学版）
• 关键词: 潜阳封髓丹 COPD 网络药理学 分子对接
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: R285
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨潜阳封髓丹干预慢性阻塞性肺疾病(COPD)的分子作用机制.方法 通过TCMSP数据库筛选潜阳封髓丹的活性化合物和靶点,以"COPD"为关键词在DisGeNET、TTD、Malacard数据库获取COPD作用靶点,提取潜阳封髓丹干预COPD的交集靶点.在STRING 11.0和DAVID 6.8数据库中分别对交集靶点进行蛋白质与蛋白质相互作用关系网络图(PPI)网络、基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析富集分析,并获取PPI网络中核心靶点.利用Cytoscape 3.8.0构建了"活性化合物-靶点""活性化合物-COPD-靶点"网络,通过Network Analysis插件筛选得出潜阳封髓丹干预COPD的核心活性化合物.使用AutoDock Vina和Python脚本将核心活性化合物与核心靶点蛋白受体进行分子对接.结果 筛选出潜阳封髓丹共有114个活性化合物和111个靶点;1494个COPD相关靶点,两数据合并共获得48个交集靶点.GO功能富集分析提示,交集靶点共涉及413个条目参与(P<0.05),主要涉及细胞凋亡的调控、细胞增殖调控、氮化合物代谢过程的调控、乙酰胆碱、类固醇激素受体活性.KEGG分析结果 发现48个靶点参与15条信号通路过程(P<0.05),主要涉及erbb信号通路、toll样受体信号通路、MAPK信号通路、p53信号通路等.分子对接中槲皮素与IL-6的结合能为-21.338 kcal/moL,表现出较好的亲和力.结论 潜阳封髓丹具有多成分、多靶点等特点,可从多种途径改善COPD的炎症、氧化应激反应,抑制气道重塑,清除气道内高分泌黏液,减轻患者的临床症状.