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利用宏基因组学技术开展幼女阴道菌群多样性分析
利用宏基因组学技术开展幼女阴道菌群多样性分析
作者:
林晶英
刘婷
张益多
唐袁婷
胡正强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
健康幼女
阴道菌群
功能
多样性
宏基因组学
摘要:
目的 利用宏基因组学技术分析成都地区健康幼女阴道菌群多样性,为全面了解健康幼女的阴道微生态环境、制定幼女阴道微生态指标正常值范围奠定基础.方法 选取2018年10月至2019年4月在四川大学华西第二医院妇科门诊就诊的4~6岁健康幼女共14例为研究对象,同时收集健康成年女性阴道分泌物标本,通过革兰染色、细菌培养和质谱分析评价2组人群样本菌群状况及差异.采用通用引物对细菌16S rDNA基因的V3-V4区进行扩增,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳,通过对DGGE特征条带切胶回收并进行克隆测序,利用GenBank中的Blast与已知序列比对,鉴定细菌菌种,分析幼女阴道菌群的多样性特征.结果 革兰染色及微生物培养表明,健康成人阴道分泌物主要菌群以革兰阳性大杆菌为主,而幼女阴道分泌物主要以革兰阴性杆菌及革兰阳性球菌为主.先农指数和辛普森指数分析发现随着年龄增长,细菌多样性呈现下降趋势.物种丰度热图分析表明,4岁组幼女阴道分泌物主要细菌为不解糖嗜胨菌、埃扎基拉菌、卟啉单胞菌和普雷沃菌;5岁组幼女阴道分泌物主要细菌为假单胞菌、鞘氨醇单胞菌、不动杆菌和肠杆菌;6岁组幼女阴道分泌物主要细菌为假单胞菌、鞘氨醇单胞菌、气单胞菌和头孢菌.基于细菌同源蛋白簇(COG)的功能丰度热图分析,发现随着年龄的增长,细菌功能在不断增加,4岁组和6岁组样本显示出明显的细菌功能差异.结论 通过宏基因组学分析发现幼女阴道常见优势菌种为假单胞菌、鞘氨醇单胞菌、不解糖嗜胨菌、普雷沃菌、气单胞菌等,与育龄妇女优势菌有很大差异.随着年龄增长,细菌多样性呈现下降趋势,而菌群功能呈增加趋势.这些发现对全面了解健康幼女的阴道微生态、制定幼女阴道微生态正常值范围具有重要意义.
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文献信息
篇名
利用宏基因组学技术开展幼女阴道菌群多样性分析
来源期刊
中国微生态学杂志
学科
关键词
健康幼女
阴道菌群
功能
多样性
宏基因组学
年,卷(期)
2021,(2)
所属期刊栏目
论著|Articles
研究方向
页码范围
154-160
页数
7页
分类号
R711.31
字数
语种
中文
DOI
10.13381/j.cnki.cjm.202102006
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宏基因组学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
中国微生态学杂志
主办单位:
中华预防医学会
大连医科大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1005-376X
CN:
21-1326/R
开本:
大16开
出版地:
大连市旅顺南路西段9号
邮发代号:
8-27
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
6899
总下载数(次)
14
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中国微生态学杂志2021年第4期
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