基于多数据库分析PARK2在泛癌中的表达与突变

• 作者: 豆雅楠 费晓炜 魏嘉良 费舟
• 来源期刊: 中华脑科疾病与康复杂志（电子版）
• 关键词: PARK2 泛癌 生存预后 基因突变 免疫浸润
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 临床研究|Clinical Researches
• 页码范围: 139-146
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.2095-123X.2021.03.003

摘要

目的 分析PARK2在泛癌中的表达与突变.方法 采用肿瘤免疫数据库TIMER2.0分析PARK2在33种肿瘤中的mRNA表达水平,探讨癌症相关成纤维细胞浸润水平与癌症基因组图谱(TCGA)不同癌症类型中PARK2基因表达的潜在关系;采用GEPIA数据库获得所有TCGA中不同PARK2表达的肿瘤患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS);采用cBioportal数据库进行泛癌种基因突变汇总并获得PARK2功能结构域图上的具体的突变位点信息;采用STRING数据库得到PARK2的蛋白相互作用网络.结果 PARK2在大多数癌症中高表达且与肿瘤患者的预后存在明显相关性.PARK2的表达与宫颈鳞癌、腺癌、结肠癌、食管癌及头颈鳞状细胞癌等癌症中的肿瘤相关成纤维细胞浸润水平相关.PARK2基因的突变和(或)缺失也参与了PARK2的功能发挥.结论 PARK2的表达与临床预后、免疫浸润等存在统计学相关性,将有助于从临床肿瘤样本的角度理解PARK2在肿瘤发生中的作用,为多癌肿的治疗提供一种潜在的靶向治疗策略.