基于生物信息学分析ANCA相关性血管炎肾损害关键基因

• 作者: 蔡昕添 张德莲 毕云伟 洪静 吴婷 杨顺帆 李南方
• 来源期刊: 医学研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: ANCA相关性血管炎肾损害 生物信息学 关键基因 分子标志物
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 52-57
• 页数: 6页
• 分类号: R593.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11969/j.issn.1673-548X.2021.01.012

摘要

目的 通过生物信息学方法 探究抗中性粒细胞胞质抗体(ANCA)相关性血管炎肾损害发生、发展的关键基因,寻找潜在的特异性分子标志物,为治疗ANCA相关性血管炎肾损害潜在靶标提供理论依据.方法 从GEO数据库检索获得GSE108109和GSE108113芯片数据,利用R语言相关程序包处理、分析基因芯片GSE108109并筛选差异基因.利用Cytoscape软件中的MCODE插件筛选出关键基因,并利用GSE108113芯片数据对关键基因进行再次验证.结果 筛选GSE108109芯片得到了187个差异基因,其中表达上调的基因35个,表达下调的基因152个.通过蛋白-蛋白相互作用网络模块化分析获得了9个核心基因,分别为CD53、C1QC、TYROBP、CSF1R、CYBB、LAPTM5、FCER1G、CTSS和C3AR1.通过GSE108113芯片数据对上述9个基因进行验证发现,CD53、C1QC、TYROBP、CSF1R、CYBB、LAPTM5、FCER1G和CTSS在ANCA相关性血管炎肾损害患者样本中表达显著上调,而C3AR1基因在ANCA相关性血管炎肾损害患者样本与健康成年人肾脏活组织样本间的表达并无显著差异.结论 通过生物信息学分析获得8个核心基因在ANCA相关性血管炎肾损害的发生、发展中发挥重要作用,为探究ANCA相关性血管炎肾损害的发病机制、发现诊断标志物和探索靶向治疗新位点提供理论依据.