非小细胞肺癌细胞A549顺铂耐药潜在机制的全转录组测序分析

• 作者: 倪耀军 徐忠能 陈胜 王俊
• 来源期刊: 中国胸心血管外科临床杂志
• 关键词: 非小细胞肺癌 顺铂耐药 全转录组测序 ceRNA网络
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 普胸外科|General Thoracic Surgery
• 页码范围: 35-42
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.7507/1007-4848.202003132

摘要

目的 通过全转录组测序分析比较野生型A549细胞和顺铂耐药A549细胞(A549/DPP)表达谱的差别,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)顺铂耐药潜在机制.方法 首先建立A549/DDP细胞系,对A549和A549/DDP进行全转录组测序,分别对lncRNA-seq,circRNA-seq和miRNA-seq数据进行差异表达以及功能富集分析(KEGG和GO分析).然后进行全转录组数据联合分析以及ceRNA网络的构建.结果 与A549细胞系相比,其中4 517个lncRNA、123个circRNA以及145个miRNA在A549/DDP细胞中有差异表达.显著富集在与癌症相关的通路上.miRNA-circRNA-lncRNA-mRNA 四元网络包含了12个miRNA,4个circRNA,23个lncRNA 和9个mRNA节点.经过拓扑学性质分析hsa-miR-125a-5p和hsa-miR-125b-5p是顺铂耐药相关的关键miRNA.结论 肿瘤坏死因子信号通路和p53信号通路参与了A549/DPP耐药机制.Hsa-miR-125a-5p和hsa-miR-125b-5p可能是逆转顺铂抗性的潜在靶点.