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小核仁RNA宿主基因4在胃癌中的预后价值及潜在作用机制
小核仁RNA宿主基因4在胃癌中的预后价值及潜在作用机制
作者:
程显斌
李兴肇
杨文涛
盖保东
姜洋
王思佳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
长链非编码RNA
小核仁RNA宿主基因4
胃癌
摘要:
目的:旨在探讨小核仁RNA宿主基因4(SNHG4)在胃癌组织中的表达、预后价值及可能作用机制。方法:运用UALCAN数据库分析SNHG4在胃癌中的表达情况;Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNHG4与胃癌预后的关系;StarBase、Targetscan、microT-CDS数据库及Cytoscape软件构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络;DAVID数据库对SNHG4相关miRNA的靶基因进行生物学功能及通路分析。结果:SNHG4在胃癌组织中的表达明显高于正常组织( P=8.882E-16)。生存分析发现SNHG4高表达的胃癌患者总体生存时间少于低表达组( P=8.900E-05)。通过RNA调控网络的构建,发现在胃癌中hsa-let-7a-5p( P=1.02E-03)、hsa-miR-152-3p( P=4.51E-06)、hsa-miR-204-5p( P=6.68E-04)和hsa-miR-363-3p( P=8.06E-03)可作为SNHG4的结合位点。SNHG4作用于这4种miRNA进一步调控250个靶基因。对靶基因的GO注释及KEGG富集分析,发现这些靶基因在蛋白质磷酸化的调节、转录负调控、RNA聚合酶II启动子的转录等生物过程中发挥作用,且通过阻断或激活Wnt等信号通路参与胃癌的发生及发展。 结论:SNHG4可作为胃癌潜在的诊断性肿瘤标志物,判断胃癌预后情况,通过构建SNHG4-miRNA-mRNA调控网络,从分子水平研究胃癌的发病机制,为实验研究及临床研究提供明确方向。
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文献信息
篇名
小核仁RNA宿主基因4在胃癌中的预后价值及潜在作用机制
来源期刊
中华内分泌外科杂志
学科
关键词
长链非编码RNA
小核仁RNA宿主基因4
胃癌
年,卷(期)
2021,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
407-412
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.cn.115807-20200518-00160
五维指标
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节点文献
长链非编码RNA
小核仁RNA宿主基因4
胃癌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华内分泌外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1674-6090
CN:
11-5807/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市渝中区袁家岗友谊路1号重庆医科大学附属第一医院
邮发代号:
创刊时间:
2007
语种:
chi
出版文献量(篇)
2271
总下载数(次)
19
总被引数(次)
6033
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