SARS-CoV-2侵袭宿主细胞的关键蛋白酶TMPRSS2的生物信息学分析

• 作者: 张利娜 文朝朝 杜相欣 张雨彤 赵欣 张策 张宇
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 关键词: SARS-CoV-2 TMPRSS2 COVID-19 生物信息学 结构与功能
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 实验研究|Experimental Studies
• 页码范围: 688-697,721
• 页数: 11页
• 分类号: R319|R373.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.088

摘要

目的 通过生物信息学分析手段,对SARS-CoV-2侵袭宿主细胞的关键蛋白酶TMPRSS2进行预测和分析,对其结构与功能进行系统性的整理,为该蛋白的研究及其抑制剂的研发提供可靠的参考.方法 通过ProtParam、Protscale、SignalP 4.0 Server、SecretomeP 2.0 server、TMHMM Server v.2.0、SOPMA、SWISS-MODEL、MEGA-X等软件对TMPRSS2基因及蛋白进行结构、功能、进化、生物过程等方面的预测,综合各软件得出的结果做出分析及论证.结果 TMPRSS2蛋白是一种由492个氨基酸组成的亲水性蛋白,它具有一个跨膜螺旋结构,是一种非经典分泌蛋白.TMPRSS2蛋白在前列腺中的表达尤为丰富,其共有3个可能的N-糖基化位点,3个可能的O-糖基化位点以及8个可能的蛋白磷酸化位点.TMPRSS2蛋白共拥有3个超家族保守结构域,其100位以后的氨基酸序列相对保守.结论 本文借助生物信息学相关软件和数据库,对TMPRSS2蛋白的结构和功能展开了较为全面的预测和分析.进一步验证了其作为丝氨酸蛋白酶的特质,同时也为其参与SARS-CoV-2侵袭宿主提供可能的机制解释.有助于进一步开展TMPRSS2相关的实验及研究.