番茄不规则裂果性状的QTL定位及候选基因分析

• 作者: 陈斌 吴震 文军琴 林昊维 于璐 薛灵姿 周蓉 蒋芳玲
• 来源期刊: 园艺学报
• 关键词: 番茄 不规则裂果 QTL定位 候选基因
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papars
• 页码范围: 1329-1339
• 页数: 11页
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-2020-1032

摘要

为挖掘调控番茄不规则裂果性状的关键基因,利用番茄易发生不规则裂果的种质'S189'和耐裂果的种质'R91'杂交获得F1代,之后F1自交构建F2群体.以F2群体中挑选出的20株易裂果单株和20株耐裂果单株的DNA分别等量混合,构成易裂池和耐裂池,进行QTL-seq分析.共检测到2个调控番茄不规则裂果性状的QTL,分别位于2号染色体的38.75～ 42.14Mb区域和5号染色体的49.07～49.48 Mb区域,暂命名为qCR2和qCR5.在qCR5的区域内仅检测到2个基因,利用2个亲本的红熟期果皮进行基因表达量分析,发现其差异均不显著.qCR2的区域较大,为快速有效地挖掘候选基因,利用43个多态性标记构建2号染色体标记连锁图,并结合F2群体裂果率进行遗传连锁分析,在多态性标记sli2734和Bin3371之间检测到1个主效QTL,其LOD值为3.05,贡献率为7.05％,且其对应的物理位置与qCR2的区域相重合.联合QTL-seq分析和遗传连锁分析将候选区域缩小至39.55～39.94 Mb,记为qCR2.1.在qCR2.1的区域内共有53个基因,利用亲本红熟期果皮进行基因表达量分析,获得3个表达量差异显著的基因Solyc02g072400、Solyc02g072470和Solyc02g076780.其中Solyc02g076780表达量差异极显著,其与乙烯调控相关,推测其为控制番茄不规则裂果性状的关键候选基因.