锦香草及其近缘种的亲缘关系ITS序列分析

• 作者: 陆彭城 张文春 陈建芳 黄学敏 叶菁 彭东辉
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 关键词: 锦香草 短毛熊巴掌 长柄熊巴掌 ITS 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 园艺科学|Horticultural Science
• 页码范围: 1436-1444
• 页数: 9页
• 分类号: S682.3|Q949.748.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2021.08.11

摘要

为厘清锦香草及其近缘种的亲缘关系,为其杂交育种提供数据基础,收集我国锦香草及其近缘种短毛熊巴掌与长柄熊巴掌等样品46份,对供试样品核糖体基因(nrDNA)的内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列进行分析,并构建系统进化树,对其系统发育关系进行研究.结果表明:供试材料的ITS1、ITS2和5.8S的序列长度分别为246、230、160～161 bp;ITS1与ITS2序列存在变异位点426个,信息位点232个;5.8S序列存在202个变异位点,信息位点84个.根据ITS序列构建进化树:供试材料可分为2支,锦香草与短毛熊巴掌在进化树中聚为一支,分支内部互相嵌入;长柄熊巴掌单独聚成一支.以上结果显示,锦香草、短毛熊巴掌亲缘关系较近,它们与长柄熊巴掌亲缘关系较远,该结果支持《Flora of China》将短毛熊巴掌处理为锦香草的异名,长柄熊巴掌为独立种.