萱草根茎低温胁迫转录组分析

• 作者: 黄长兵 程培蕾 杨绍宗 张焕朝 姜正之 金立敏
• 来源期刊: 浙江农业学报
• 关键词: 萱草 转录组 差异表达基因 低温胁迫
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 园艺科学|Horticultural Science
• 页码范围: 1445-1460
• 页数: 16页
• 分类号: S682.1+9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1524.2021.08.12

摘要

低温胁迫是萱草育种和生产中最严重的非生物胁迫之一.该研究以耐冷型和冷敏感型萱草低温处理前后的根茎为材料,利用转录组测序(RNA-seq)技术,比较了耐冷型和冷敏感型萱草在低温胁迫下的基因表达差异.结果表明,4个样品获得的高质量clean reads均大于35880734条;低温处理后,耐冷型萱草差异表达基因数量多于冷敏感型,差异表达基因主要富集于次级代谢产物等相关途径,Ca2+信号通路基因、MAPKs信号通路基因、转录因子和热激蛋白基因表达在2种萱草中表现出不同的变化,可能导致2种萱草在低温胁迫中的不同反应.qRT-PCR验证结果显示,差异基因的表达变化趋势与RNA-seq结果一致.该研究表明Ca2+信号通路基因、MAPKs信号通路基因在萱草响应低温胁迫过程中发挥着重要作用.