枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类(CAZymes)的分布与进化分析

• 作者: 祝友朋 韩长志
• 来源期刊: 西南农业学报
• 关键词: 枯草芽孢杆菌BEST195 碳水化合物活性酶 预测程序 遗传关系
• 年，卷（期）: 2021,（6）
• 所属期刊栏目: 耕作栽培·生理生化|TILLAGE & CULTIVATION · PHYSIOLOGY & BIOCHEMISTRY
• 页码范围: 1195-1200
• 页数: 6页
• 分类号: S436
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2021.6.009

摘要

[目的]分析枯草芽孢杆菌BEST195的碳水化合物酶类的分布与进化情况,对枯草芽孢杆菌工业菌株的开发利用具有重要意义.[方法]利用CAT在线预测程序对前期获得的102个分泌蛋白序列进行CAZymes预测.[结果]明确枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的数量为57个,分别为27个GH、21个CBM、2个CE、4个PL、1个GT和2个GH/CBM.同时,通过对上述CAZymes进行遗传关系分析,明确存在GH/PL/CBM、GH/CBM、GH/CBM/CE/PL、GH/CBM/CE/PL/GT等大的类别;以及通过对上述蛋白互作关系分析,发现大部分CAZymes蛋白已具有明显的结构特征和相互作用的关系.[结论]完成了枯草芽孢杆菌BEST195中CAZymes的预测,并明确CAZymes在分类方面尚需进一步细分为亚类,该项目为开展工业菌株发挥CAZymes蛋白功能研究打下了坚实的理论基础.