基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
为探究不同强度红光对茶树苯丙烷类代谢的影响,通过高通量测序技术对不同强度红光处理的福建水仙茶树新梢进行转录组测序,其中以白色LED灯(100 μmOl-2 m-2s-1)为基础光照,补充3个不同强度红光即120、240、480 μmol-2 m-2s-1.结果 显示:补充3个不同强度红光与对照相比,分别检测到1693个(上调408和下调1285)、879个(上调135和下调744)和6个(上调3和下调3)差异表达基因.利用GO和KEGG数据库,对差异基因进行代谢通路富集分析,发现补充120和240 μmol-2 m-2 s-1红光茶树的差异基因显著富集在苯丙烷类生物合成、氨基糖和核苷酸糖代谢等代谢通路中.利用实时荧光定量PCR验证了随机挑选的9个差异基因(其中4-香豆酸辅酶A连接酶(TEA034012)、乙醛脱氢酶(TEA033457)、肉桂醇脱氢酶(TEA025404)和咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(TEA030958)是苯丙烷类代谢途径的基因)在不同强度红光处理的相对表达量,结果与转录组测序结果的变化趋势一致.本研究表明4CL、CAD和COMT可能是红光调控下苯丙烷类生物合成代谢途径中的关键基因,该结果可为茶树次生代谢机制的调控研究提供借鉴.
推荐文章
不同品种茶树新梢响应“倒春寒”的转录组分析
茶树
倒春寒
转录组
差异基因
不同品种茶树新梢响应"倒春寒"的转录组分析
茶树
倒春寒
转录组
差异基因
天麻苯丙烷代谢途径的转录组学分析
天麻
转录组
差异表达基因
苯丙烷类代谢
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 基于转录组分析不同强度红光对茶树苯丙烷类代谢的影响
来源期刊 应用与环境生物学报 学科
关键词 茶树 红光 转录组 差异基因 苯丙烷类代谢
年,卷(期) 2021,(6) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1636-1644
页数 9页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.19675/j.cnki.1006-687x.2020.06047
五维指标
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (0)
共引文献  (0)
参考文献  (0)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
2021(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
茶树
红光
转录组
差异基因
苯丙烷类代谢
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
应用与环境生物学报
双月刊
1006-687X
51-1482/Q
大16开
成都市人民南路4段9号
62-15
1995
chi
出版文献量(篇)
3881
总下载数(次)
7
总被引数(次)
69679
论文1v1指导