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甜瓜种皮颜色控制基因CmSC1的精细定位及候选基因分析
甜瓜种皮颜色控制基因CmSC1的精细定位及候选基因分析
作者:
马建
李丛丛
黄亚婷
谢雨黎
程玲玲
王建设
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甜瓜
种皮颜色
基因定位
原花青素
bHLH转录因子
摘要:
[目的]通过对甜瓜种皮颜色进行遗传分析及基因精细定位,并推测其候选基因和开发特异分子标记,为下一步该基因的功能研究及合理利用奠定基础.[方法]利用白色种皮材料HP22和黄色种皮材料B8、B150分别配制杂交组合,获得后代遗传分离群体并进行种皮颜色的表型调查及遗传分析,通过基因图位克隆方法完成基因的精细定位.通过对定位区间内注释基因进行编码区序列和功能分析确定关键候选目的基因.[结果]甜瓜白色种皮对黄色种皮为显性,由单显性基因 CmSC1控制并表现延迟遗传效应.利用368个黄色种皮F2单株最终将CmSC1精细定位于第5号染色体分子标记S27和S28之间物理距离约95 kb区间内,共包含12个注释基因.其中一个为拟南芥AtTT8同源的编码bHLH转录因子蛋白的MELO3C014406,经序列变异位点分析,黄色种皮材料B8和B150分别在该基因ATG下游第47位碱基处插入碱基A以及在第260位碱基处缺失14 bp导致翻译蛋白提前终止,致使后面功能结构域完全缺失,进而通过开发特异分子标记YS及序列分析,发现65份黄色种皮材料均发生这两种突变形式中的一种,推测MELO3C014406即为控制种皮颜色CmSC1的目的基因.[结论]本研究将控制种皮颜色的CmSC1精细定位于第5染色体95 kb区间内,推测MELO3C014406为最终目的基因,并开发了特异分子标记YS.
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文献信息
篇名
甜瓜种皮颜色控制基因CmSC1的精细定位及候选基因分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
甜瓜
种皮颜色
基因定位
原花青素
bHLH转录因子
年,卷(期)
2021,(10)
所属期刊栏目
园艺|HORTICULTURE
研究方向
页码范围
2167-2178
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2021.10.012
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研究主题发展历程
节点文献
甜瓜
种皮颜色
基因定位
原花青素
bHLH转录因子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
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