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盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析
盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析
作者:
梁书荣
赵政文
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
垂穗披碱草
盐胁迫
转录组
基因差异表达
摘要:
为探究垂穗披碱草在盐胁迫下的分子响应机制,将200 mmol/L NaCl处理0、6、12、24、36 h的垂穗披碱草叶片进行转录组测序.结果表明,共获得转录本序列数量为462235条,经过注释分析获得单基因序列数量229597条,这些差异基因涉及氨基酸的合成和代谢、淀粉和蔗糖代谢、类黄酮生物合成、碳代谢和植物激素信号传导等途径,可作为研究垂穗披碱草盐胁迫响应主要研究机制.荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表明,挑选的7个差异表达基因的表达趋势与测序结果相一致,说明测序结果准确可靠.本研究测序结果为垂穗披碱草的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供了理论参考.
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篇名
盐胁迫下垂穗披碱草叶片转录组差异表达分析
来源期刊
江苏农业科学
学科
关键词
垂穗披碱草
盐胁迫
转录组
基因差异表达
年,卷(期)
2021,(18)
所属期刊栏目
生物技术
研究方向
页码范围
65-71
页数
7页
分类号
S184
字数
语种
中文
DOI
10.15889/j.issn.1002-1302.2021.18.010
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期刊影响力
江苏农业科学
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1002-1302
CN:
32-1214/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号
邮发代号:
28-10
创刊时间:
1973
语种:
chi
出版文献量(篇)
24128
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53
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