CXCL2和THBS2在结肠癌诊断、预后及免疫浸润中的生物信息学分析

• 作者: 张雨雁 陈学军
• 学科: 医学
• 关键词: 结肠癌 生物信息学 差异表达基因 诊断 预后 免疫浸润 CXCL2 THBS2
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 154-162
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13267/j.cnki.syzlzz.2022.025

摘要

目的 通过生物信息学方法，筛选可能与结肠癌诊断、预后及免疫浸润相关的基因。方法 从 GEO 数据库中下载数据集，并筛选出结肠癌差异基因，通过 STRING 数据库和 Cytoscape 软件筛选出核心基因 CXC 型趋化因子配体 2（CXC chemokine ligand 2，CXCL2）和血小板反应蛋白 2（thrombospondin-2，THBS2）。通过 GEPIA 和 UALCAN 数据库分析 CXCL2 和 THBS2 表达水平与预后关系以及其表达与结肠癌患者临床特征之间的关系。TIMER 数据库分析 CXCL2 和 THBS2 与结肠肿瘤免疫细胞浸润的相关性。LinkedOmics 和 DAVID 数据库分析 CXCL2 和 THBS2 基因的正相关基因和 KEGG 通路。结果 鉴定出结肠癌相关的核心基因 16 个，包括 CXCL2 和 THBS2。CXCL2 和 THBS2 在结肠癌中的表达均高于正常组织（均 P<0.05），且在年龄、性别、分期和淋巴结转移方面比较，差异均具有统计学意义（均 P<0.05）。CXCL2 高表达组患者 5 年生存率高于低表达组（P<0.05），THBS2 高表达组患者 5 年生存率低于低表达组（P<0.05）。CXCL2 和 THBS2 基因参与结肠癌肿瘤细胞的免疫浸润。KEGG 通路显示 CXCL2 主要参与细胞因子受体的相互作用、肿瘤坏死因子（tumor necrosis factor，TNF）信号通路和趋化因子信号通路等。THBS2 主要参与细胞外基质（extracellular matrix，ECM）-受体相互作用、血小板活化和磷脂酰肌醇 3- 激酶 / 蛋白激酶 B（phosphatidylinositide 3-kinases/protein kinase B，PI3K-Akt）信号通路等。结论 CXCL2 和 THBS2 为结肠癌诊断及预后相关基因，参与多种分子调控通路，可作为结肠癌潜在的生物标志物。