基因AL360181.1调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析

• 作者: 刘牧林 史维俊 吴华彰 李欣灿 温贺新
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: AL360181.1 结直肠癌 mTOR 进展及预后 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 731-737
• 页数: 7页
• 分类号: R363
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb202005018

摘要

目的 通过生物信息学方法分析基因AL360181.1在结直肠癌进展及预后中的作用,并进一步预测可能的分子机制.方法 从TCGA数据库下载结直肠癌基因表达数据及临床数据,应用Perl及R软件对数据整理后筛选出差异表达的基因,进一步对差异基因批量化行生存、独立预后及临床病理相关性分析,选取相关性最强的差异基因作为目的基因;分析目的基因的表达与结直肠癌不同临床病理特征的相关性及对患者预后的影响;采用R软件对不同的临床病理特征行独立预后分析;分析目的基因以及不同临床病理与患者生存预后的关系;应用GSEA对目的基因行KEGG通路富集分析并利用R软件分析目的基因与潜在靶基因的相关性,预测目的基因调控结直肠癌进展及预后可能的机制.结果 基因AL360181.1在结直肠癌组织中显著高表达(P<0.01);AL360181.1与结直肠癌的分级、TNM分期具有相关性(P<0.05);基因AL360181.1、年龄、肿瘤分级、TNM分期与患者预后相关(P<0.05),且基因AL360181.1及年龄可作为评价患者预后的独立风险因子;基因AL360181.1的表达水平、患者年龄、分级及TNM分期与患者的生存状态相关(P<0.05);GSEA富集分析显示基因AL360181.1在mTOR信号通路中被富集;基因AL360181.1与潜在靶基因的相关性分析显示,AL360181.1与mTOR、AKT、KLKB1、RICTOR、TSC1、TSC2具有相关性(|R|>0.1、P<0.05).结论 基因AL360181.1可通过AKT/mTOR信号通路调节结直肠癌的进展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘牧林	蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科	66	423	11.0	19.0
2	吴华彰	蚌埠医学院生物医学系	22	108	6.0	10.0
3	史维俊	蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科	4	0	0.0	0.0
4	温贺新	蚌埠医学院第一附属医院胃肠外科	3	0	0.0	0.0