结直肠癌中FAM135B基因的表达及功能的生物信息学分析

• 作者: 严江 梁家宏 许侨东
• 来源期刊: 岭南现代临床外科
• 学科: 医学
• 关键词: FAM135B 结直肠癌 生物信息学分析 免疫组化 预后
• 年，卷（期）: 2018,（3）
• 所属期刊栏目: 论著与临床研究
• 页码范围: 265-268
• 页数: 4页
• 分类号: R735.3+7
• 字数: 2636字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-976X.2018.03.006

摘要

目的 通过生物信息学分析研究结直肠癌与正常结肠粘膜间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测参与结直肠癌发生发展中的关键基因.方法 从GEO表达谱数据库中下载表达谱基因芯片数据GSE50760(包括18例结直肠癌样本及配对的正常结肠粘膜组织).利用Morpheus在线软件对基因芯片GSE50760的数据进行分析,获得在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中差异表达的基因,并构建聚类分析热图.利用human protein atlas在线数据库获得差异表达基因在结直肠癌与正常结肠粘膜组织中的免疫组化表达水平.并进一步利用human protein atlas数据库的数据对差异表达基因在结直肠癌患者中的表达高低进行生存分析.结果 通过分析GSE50760获得前100个差异表达的基因.利用human protein atlas在线数据库对这100个差异表达基因的免疫组织表达水平进行分析发现,FAM 135B基因在结直肠癌组织中的表达比正常结肠粘膜中的表达明显下调.生存分析也提示当FAM 135B基因高表达时,结直肠癌患者的预后相对较好.结论 FAM135B可能是结直肠癌中潜在的抑癌基因,其表达下调在结直肠癌的发生发展过程发挥重要作用,并可能成为判断结直肠癌患者预后的重要的生物学指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严江	汕头大学医学院第一附属医院胆胰微创外科	31	144	7.0	10.0
2	梁家宏	汕头大学医学院第一附属医院胆胰微创外科	8	20	3.0	4.0
3	许侨东	汕头大学医学院第一附属医院胆胰微创外科	2	0	0.0	0.0