基于SSR标记的河南省狗牙根遗传多样性及群体遗传结构分析

• 作者: 任雪锋 邓亚博 臧国长 郑轶琦
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 河南省 狗牙根 遗传多样性 遗传分化 遗传结构
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 60-70
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10. 11686/cyxb2021196

摘要

应用SSR分子标记，对河南省15个居群共288份狗牙根材料进行遗传多样性及群体遗传结构分析，结果表明，10对引物共扩增出173条条带，其中163条为多态性条带，多态性条带百分率为94.29%，表明河南省狗牙根具有丰富的多态性。15个居群间的遗传分化系数为0.3857，即发生在居群间的遗传变异达到38.57%，大部分的遗传变异发生在居群内部，居群间基因流为0.7964，居群之间存在一定程度的基因交流。不同居群间遗传一致度的变化范围是0.746~0.964，平均为0.767。15个居群间的UPGMA聚类分析结果表明居群间没有完全按照地理来源进行聚类，遗传距离和地理距离矩阵之间的Mantel检验结果表明狗牙根居群间的遗传距离与地理距离之间无相关性。288份狗牙根材料之间的遗传距离为0.0173~0.5205，平均为0.3113，UPGMA聚类结果将所有材料分为3组。基于Structure软件的群体遗传结构分析结果表明，可将288份狗牙根材料分为2个亚群和一个混合型群体，与288份材料的UPGMA聚类结果基本一致，由此可判断两个亚群的遗传背景单一，混合型群体存在一定的种质基因渗透，遗传背景较为复杂。