转录组和iTRAQ技术联合揭示玉米根系的耐旱机制

• 作者: 白明兴 庄泽龙 姬祥卓 彭云玲
• 来源期刊: 干旱地区农业研究
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 根系 转录组 蛋白质组 关联分析 耐旱机制
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 植物抗逆生理|Plant Adverse-resistance Physiology
• 页码范围: 59-68
• 页数: 10页
• 分类号: S513|Q945.78
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-7601.2022.02.08

摘要

采用RNA-Seq技术和iTRAQ技术对耐旱性不同的两玉米自交系(昌7-2和TS141)的幼苗根系差异基因(DEGs)和差异蛋白(DEPs)进行关联分析.定量关联分析结果表明,Chang 7-2 D1 vs CK1、Chang 7-2 D2 vs CK2、TS141 D1 vs CK1和TS141 D2 vs CK2等4个比较组中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因相关系数分别为0.7993、0.5673、0.6406、0.6588,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因相关系数分别为-0.7222、-0.5752、-0.7996、-0.7339;此外,通过对每个自交系的D1 vs CK1和D2 vs CK2关联结果进行整合后发现,在干旱胁迫下,昌7-2中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有19个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有9个,TS141中mRNA和蛋白表达趋势相同的基因有11个,mRNA和蛋白表达趋势相反的基因有0个,表明植物根系在转录和转录后调控过程中存在差异.KEGG分析发现4个比较组所关联到的DEGs/DEPs主要涉及苯丙素的生物合成、次生代谢产物的生物合成和核糖体等,这些通路可能是不同自交系幼苗根系共同响应干旱胁迫的主要通路.在昌7-2和TS141中挑选9个DEPs/DEGs表达趋势相同的基因进行qRT-PCR分析表明,9个DEPs/DEGs的表达趋势与它们的RNA-Seq和iTRAQ结果基本一致.