2020年黑河市某规模化牛场BAstV检测及ORF1a基因遗传变异分析

• 作者: 杨硕 朱庆贺 王笑冉 孙东波
• 来源期刊: 黑龙江八一农垦大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: BAstV ORF1a基因 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 动物科学|ANIMAL SCIENCE
• 页码范围: 52-58
• 页数: 7页
• 分类号: Q858.28
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2090.2022.02.008

摘要

为调查2020年黑河市某规模化奶牛养殖场中牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)的感染及遗传进化情况,应用RT-PCR方法对该牛场的腹泻样品进行检测,并对BAstV ORF1a基因进行扩增、测序以及遗传进化分析.结果表明,15份腹泻粪便样品中,BAstV的检测阳性率为20％(3/15),对测序成功的2株BAstV毒株进行序列分析显示,鉴定的2株BAstV毒株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.3％和99.4％.2株毒株都与我国BAstV四川流行毒株,登录号NC_037655.1核苷酸同源性较高,分别为96.6％和97.3％,而其与嗜神经型BAstV欧洲毒株,KX266908.1差异较大,核苷酸同源性分别为36.7％和37.4％.系统发育进化树结果显示,试验鉴定的2株BAstV与已报道的其他中国BAstV流行参考毒株关系密切.