2012年－2014年闽西地区 PRRSV 流行株ORF5基因遗传变异分析

• 作者: 刘建奎 曾建平 杨炳辉 陈安妮 陈小燕 黄春芳 龚丽珍
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF5 基因 反转录-聚合酶链反应 遗传变异
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 7-12
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6|Q789
• 字数: 4250字
• 语种: 中文

摘要

为了研究2012年－2014年闽西地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)流行毒株的分子生物学特性和变异规律,对分离自闽西多个地区25份疑似 PRRS 病料的10个 PRRSV 分离株,应用 RT-PCR 对其中 ORF5基因进行扩增及序列分析,从而了解闽西地区 PRRSV 的遗传变异性.结果表明,10个毒株均为美洲型 PRRSV,9株 PRRSV ORF5基因全长为603 bp(FJ05 为600 bp),10个毒株 ORF5基因之间的核苷酸同源性为88．4％~99．3％；与 VR-2332、MLV 和 CH-1a 毒株的核苷酸同源性为88．3％~98．8％,与我国高致病性代表毒株 JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．9％~99．0％,与欧洲型毒株代表毒株 LV 的同源性为63．8％~65．0％.ORF5基因推导氨基酸序列变异主要发生在9-40位和58-62位,10株 PRRSV ORF5氨基酸同源性为88．5％~99．5％；与 VR-2332、MLV 和 CH-1a 的氨基酸同源性为87．5％~98．5％,与我国高致病性代表毒株 JXA1、WUH1、HUN4等的同源性为88．0％~99．5％,与欧洲型毒株代表毒株 LV的同源性为56．6％~59．2％.遗传进化树表明,闽西地区 PRRSV 可以分为疫苗株(1株,10％)、中等毒力PRRSV(1株,10％)和 HP-PRRSV(8株,80％)3个亚群,其中以 HP-PRRSV 为主,表明闽西地区 PRRSV流行毒株呈现遗传变异多样性.