陕西省部分地区PRRSV流行毒株ORF3和ORF5基因的遗传变异分析

• 作者: 于三科 付明哲 何亚鹏 张琪 徐丽美 许信刚
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪繁殖与呼吸综合征病毒 ORF3基因 ORF5基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: S855.1
• 字数: 3181字
• 语种: 中文

摘要

为了解陕西省猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传和变异情况,对9份疑似感染PRRSV的病料用RT-PCR方法分别扩增ORF3和ORF5基因,并进行测序和序列分析.测序结果表明,ORF3基因在254-490和646-737位置之间发生不连续碱基突变;与GenBank已发表的国外毒株ORF3基因组比较,同源性为89.2%~94.8%,与国内发表的ORF3基因比较,同源性为88.8%~99.0%,其中与2009年陕西分离株(HQ843181.1)同源性为94.9%~98.7%,与2010年陕西株(KJ855518.1)同源性为94.9%~98.6%.ORF5基因突变主要在508-600碱基位置之间,与GenBank上已发表的国外毒株ORF5基因组比较,同源性为90.1%~92.1%,与国内发表的ORF5基因比较,同源性为89.6%~99.2%,其中与2009年陕西分离株(HQ843181.1)同源性为95.2%~98.4%,与2010年陕西株(KJ855518.1)同源性为95.2%~98.7%.ORF3和ORF5基因进化树中Wn-2、Ak-3和Tc-4毒株在同一个进化支上,之间亲缘关系近,Xy-1和Hz-5毒株分别在不同的进化分支上,与其他毒株遗传距离较远.陕西省PRRSV流行毒株的ORF5和ORF3基因组与国内PRRSV分离株相比较均有一定变异,且亲缘进化不完全相同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许信刚	西北农林科技大学动物医学院	116	501	10.0	14.0
2	张琪	西北农林科技大学动物医学院	75	218	9.0	11.0
3	付明哲	西北农林科技大学动物医学院	94	346	10.0	14.0
4	于三科	西北农林科技大学动物医学院	78	474	10.0	18.0
5	徐丽美	西北农林科技大学动物医学院	5	4	1.0	2.0
6	何亚鹏	西北农林科技大学动物医学院	20	41	4.0	5.0