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摘要:
目的 对北京地区肉类产品中单增李斯特菌进行全基因组测序,了解不同序列型分布特点及不同菌株间的亲缘关系.方法 采用高通量测序技术对110株单增李斯特菌进行全基因组测序、多位点序列分型(MLST)分析,采用相关软件对测序数据进行基因组装、基因预测与功能注释.采用抗性基因数据库(CARD)、毒力因子数据库(VFDB)筛选耐药基因、致病基因.结果 110株分离菌株全基因组测序MLST分型共分为17个ST型,其中1株菌为ST新型(STnew1),ST9为优势型.新型STnew1具有大环内酯类、氨基糖苷类、恶唑烷酮类、氯霉素类、四环素类、甲氧苄氨嘧啶类等多种耐药基因,缺失基因prfA、hpt、plcA、plcB、inlC、hlyA.其中20.9%的菌株均携带耐药基因.除6株无害李斯特菌外,其余菌株均携带单增李斯特菌毒力岛(LIPI-1).结论 肉类食品中单增李斯特菌存在多种耐药基因,毒力基因分布以毒力岛(LIPI-1)为主,具有潜在的致病性;相关部门应加强肉类及肉类制品的监管,进一步降低单增李斯特菌所致食源性疾病流行风险.
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文献信息
篇名 北京地区食源性单增李斯特菌基因分型分析
来源期刊 中国公共卫生 学科 医学
关键词 全基因组测序 单增李斯特菌 基因分型 毒力基因 耐药基因
年,卷(期) 2022,(1) 所属期刊栏目 调查报告与分析|Survey and Report
研究方向 页码范围 105-109
页数 5页 分类号 R517.7
字数 语种 中文
DOI 10.11847/zgggws1132726
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研究主题发展历程
节点文献
全基因组测序
单增李斯特菌
基因分型
毒力基因
耐药基因
研究起点
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引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国公共卫生
月刊
1001-0580
21-1234/R
128
沈阳市和平区砂阳路242号
8-204
1985
chi
出版文献量(篇)
15951
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19
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137644
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