哈尼梯田稻鲤共作与单养模式下福瑞鲤肠道菌群结构比较研究

• 作者: 聂志娟 徐钢春 邵乃麟 王保战 高建操 徐跑 何健
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 哈尼梯田 稻-鲤综合种养 菌群结构 肠道 高通量测序
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告|RESEARCH ARTICLES
• 页码范围: 1473-1484
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20210472

摘要

[目的]分析不同养殖模式的福瑞鲤肠道菌群结构组成和群落特征.[方法]通过16S rRNA高通量测序技术,分析比较哈尼梯田稻鲤共作、传统池单养、水泥池单养模式下的福瑞鲤肠道菌群的结构组成和丰度差异.[结果]梯田稻鲤组(RCIC)、传统池鲤组(YPIC)和水泥池鲤组(HPIC)分别获得了2 345、238和118个OTU.RCIC组的Sobs指数及PD指数最高,显著高于YPIC组(P＜0.05),极其显著高于HPIC组(P＜0.01);池塘单养模式下,两组之间多样性指数也存在显著差异,YPIC组大于HPIC组(P＜0.05).含量大于10％优势菌门:RCIC组主要为变形菌门(39.39％)、梭杆菌门(38.55％)和厚壁菌门(15.4％);YPIC组为变形菌门(21.87％)、梭杆菌门(58.27％);HPIC组为变形菌门(46.63％)、梭杆菌门(53.14％).变形菌和梭杆菌为3组福瑞鲤肠道样品的优势菌群,其中的鲸杆菌属(Cetobacterium)、气单胞菌属(Aeromonas)为核心优势菌属.LEfSe线性判别分析(LDA＞3)显示17个具有差异的标记菌属,其中Romboutsia、Clostridium_sensu_stricto_1、Enterobacter、Paraclostridium、Methylobacterium、norank_f_norank_o_Chloroplast、Edwardsiella、Epulopiscium为RCIC组具有的差异标记菌属.[结论]不同养殖模式的福瑞鲤既有固有菌群,也塑造差异显著的肠道菌群组成结构.稻梯田鲤肠道菌群丰富度和多样性显著增加,且具有更多的有益差异标记菌属,获得更健康的肠道菌群群落特征.