盐碱池塘养殖鲤肠道菌群的分子分析

• 作者: 冯志云 刘哲 王建福 蔡原 黄进强
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 鲤 肠道菌群 16S rRNA 盐碱池塘 养殖
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 707-715
• 页数: 9页
• 字数: 6247字
• 语种: 中文

摘要

为了了解盐碱池塘养殖鲤肠道细菌群落组成及多样性,提取鲤(Cyprinus carpio L.)肠道细菌基因组DNA,选用细菌通用引物对16S rRNA基因进行了PCR扩增,构建了细菌16S rRNA基因克隆文库.通过对阳性克隆子进行限制性片段长度多态性分析(RFLP),选出有代表性的克隆子进行测序、BLAST比对分析和构建系统发育树.本研究从16S rRNA基因文库中共筛选出176个阳性克隆,经RFLP分析得到28个不同分类操作单元(operational taxonomic unite,OTU)(GenBank登录号:JX262557～JX262584),文库覆盖度为88.6％.16S rRNA序列系统发育分析发现,盐碱塘养殖鲤肠道细菌归属于变形细菌门(Proteobacteria)(包含Alpha和Gamma亚群)、厚壁细菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和梭杆菌门(Fusobacteria)4个门,分别占克隆总数的89.9％、7.9％、1.1％和1.1％.其中,变形细菌门的α-变形菌纲(占克隆总数的88.1％)为优势类群,气单胞菌属为优势菌属.本研究揭示了盐碱池塘养殖条件下健康鲤肠道细菌群落组成.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘哲	甘肃农业大学动物科学技术学院	65	403	11.0	18.0
2	蔡原	甘肃农业大学动物科学技术学院	44	201	7.0	12.0
3	王建福	甘肃农业大学动物科学技术学院	43	147	7.0	10.0
4	黄进强	甘肃农业大学动物科学技术学院	12	50	5.0	7.0
5	冯志云		13	21	2.0	4.0