3种DNA提取方法对养殖池塘不同生境菌群PCR-DGGE分析的影响

• 作者: 何夙旭 周志刚 姚斌 白东清
• 来源期刊: 中国农业科技导报
• 学科: 农学
• 关键词: 养殖池塘 菌群 PCR-DGGE
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 专栏:863课题研究进展
• 页码范围: 73-79
• 页数: 7页
• 分类号: S962.3+2
• 字数: 4156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-0864.2009.01.013

摘要

比较3种DNA提取方法(溶菌酶法、CTAB法及珠磨法)对养殖池塘几种生境(底泥、饲料、草鱼肠道内容物及肠道壁)菌群PCR-DGGE分析的影响.结果表明,以3种提取方法获得的DNA为馍饭均能进行16SrDNA V3区特异性片段扩增;但不同DNA提取方法对池塘不同生境菌群DGGE指纹图谱存在显著影响.DGGE指纹图潜显示草鱼肠道内容物菌群(溶菌酶法)与肠道壁菌群(溶菌酶法)存在较高一致性,底泥菌群(CTAB法)及饲料菌群(溶菌酶法)与鱼体肠道菌群(包括内容物菌群和肠道壁菌群)则存在日明显差异,但肠道菌群与底泥菌群的相似度相对更高.研究提示采用微生物分子生态学工具对养殖池塘小同生境进行菌群结构分析时,需提前优化DNA提取方法;在以投饲为主的养殖鱼塘中,草鱼肠道菌群更多源自于池塘底泥.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚斌	中国农业科学院饲料研究所农业部饲料生物技术重点实验室	111	2079	24.0	42.0
2	白东清	天津农学院水产科学系天津市水产生态及养殖重点实验室	138	617	14.0	19.0
3	周志刚	中国农业科学院饲料研究所农业部饲料生物技术重点实验室	26	254	10.0	15.0
4	何夙旭	中国农业科学院饲料研究所农业部饲料生物技术重点实验室	16	171	7.0	13.0