DNA不同提取方法对养殖池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE检测的影响

• 作者: 吴淑勤 林文辉 毕晔 王亚军 王宇 石存斌
• 来源期刊: 吉林农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 养殖池塘底泥 细菌多样性 DNA提取 PCR-DGGE 优势种群
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 页码范围: 771-776
• 页数: 6页
• 分类号: S955
• 字数: 5042字
• 语种: 中文

摘要

应用PCR-DGGE技术研究了养殖池塘底泥中细菌DNA 5种提取方法对细菌多样性检测的影响.结果显示:(1)DNA粗提液中腐殖酸与蛋白的纯度无正相关;(2)5种方法提取的DNA粗提液经过纯化后进行PCR均取得良好结果;(3)采用复合破壁方法提取养殖池塘底泥细菌DNA有利于显示细菌多样性;(4)DNA提取方法是影响池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE结果的关键因素,与DNA的产量、纯度关系甚微;(5)5种方法相似性高达0.79,在对养殖池塘底泥细菌多样性进行粗略分析时均可使用;(6)本试验中,基于改进的Martin-Laurent法是用于养殖池塘底泥细菌多样性PCR-DGGE研究的较好的总DNA提取方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴淑勤	中国水产科学院珠江水产研究所	121	1516	22.0	31.0
2	王亚军	中国水产科学院珠江水产研究所	23	170	6.0	12.0
3	林文辉	中国水产科学院珠江水产研究所	24	161	6.0	12.0
4	石存斌	中国水产科学院珠江水产研究所	105	1345	22.0	31.0
5	王宇	中国水产科学院珠江水产研究所	17	32	4.0	5.0
9	毕晔	中国水产科学院珠江水产研究所	2	10	2.0	2.0