基于GEO和TCGA数据库筛选子宫内膜癌发病及预后的相关基因

• 作者: 邱雨欢 李留霞
• 来源期刊: 河南医学研究
• 学科: 医学
• 关键词: 子宫内膜癌 差异表达基因 关键基因 生物信息
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 793-799
• 页数: 7页
• 分类号: R737.33
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-437X.2022.05.007

摘要

目的 通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发病及预后相关的基因.方法 下载基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出EC与正常子宫内膜组织细胞中的差异表达基因(DEGs).运用STRING在线数据库及DAVID在线数据库对DEGs进行蛋白-蛋白互作网络(PPI)分析、基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析,并利用Cytoscape软件筛选出关键基因.通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库中的子宫内膜癌的生存资料对关键基因进行生存分析.结果 本研究共筛选出EC相关108个DEGs,其中10个关键基因为JUN、UBE2I、WT1、GATA2、WNT2、CXCL12、ZEB1、TCF4、FOXL2、PRKCA,均在 EC 中相对高表达.WNT2、TCF4和 FOXL2关键基因对患者的生存率差异有统计学意义(P＜0.05).Wnt信号通路可能对EC的发病有重要作用.结论WNT2、TCF4和FOXL2与EC的发病及预后有着密切关系,为EC新的诊断标志物和治疗靶点筛选提供新思路.