可逆共价抑制剂与肠肽酶的结合机制

• 作者: 朱文友 张东华 董方远 庄文昌
• 来源期刊: 山东化工
• 学科: 工学
• 关键词: 肠肽酶 可逆共价抑制剂 分子对接 计算化学
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 科研与开发
• 页码范围: 44-50
• 页数: 7页
• 分类号: TQ460.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-021X.2022.04.014

摘要

肠肽酶(EP)是一种丝氨酸蛋白酶,可作为治疗代谢性疾病的靶点,肠肽酶的可逆共价抑制剂具有临床相关的疗效.本文以卡莫司他为小分子母体,构建了30个潜在的肠肽酶可逆共价抑制剂,运用AutoDock4.2软件,将30种抑制剂小分子对接到肠肽酶的活性中心.对接结果显示肠肽酶的活性中心的Asp181、Glu210、Ser182、Ser187等残基与抑制剂小分子形成氢键,His41上的芳香性基团与抑制剂小分子上的芳香性基团形成π-π堆积,6,11,18,20,26号抑制剂小分子与肠肽酶对接的结合能分别为-9.98,-9.89,-9.89,-9.83,-9.82 kcal/mol,他们的抑制常数分别为47.96,56.08,55.94,62.58,63.3 nM,表明结合构象较稳定,其中6号抑制剂小分子的对接结果最好.