禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白的找寻

• 作者: 喻红稠 韩长志
• 来源期刊: 科学技术与工程
• 学科: 农学
• 关键词: 禾谷炭疽菌 七跨膜结构域 候选GPCR 生物信息学
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 论文|Papers
• 页码范围: 103-109
• 页数: 7页
• 分类号: S763.1|S435.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-1815.2022.01.011

摘要

G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptor,GPCR)是生物中一类具有典型七跨膜结构域的重要细胞表面受体,对细胞信号转导过程具有重要作用.禾谷炭疽菌严重危害着玉米、高粱等禾本科植物的产业发展,然而,对于该菌中GPCR蛋白数量及功能尚未有系统性报道.基于典型GPCR蛋白序列所具有的七跨膜保守结构域特征,通过TMHMM、Philius和TOPCONS 3种常用软件进行在线分析,明确全部蛋白的预测功能与蛋白数量、跨膜结构域数量与蛋白数量、氨基酸序列长度与蛋白数量之间的关系.结果表明,禾谷炭疽菌中含有243个具有七跨膜结构域蛋白(涉及含有7个跨膜结构域但不含有信号肽序列蛋白或者含有信号肽序列的具有8个跨膜结构域的蛋白),进一步通过SMART保守结构域分析,可知该菌中存在220个候选GPCR蛋白.该研究为进一步开展禾谷炭疽菌候选GPCR蛋白的理化性质解析提供了重要的数据支撑,也为进一步明确GPCR蛋白及其功能的研究奠定重要的理论基础.