基于SSR分子标记的自然状态下蕨麻采样策略研究

• 作者: 田甜 李军乔 马斌 王鑫慈 曲俊儒
• 来源期刊: 草业学报
• 关键词: 蕨麻 SSR分子标记 毛细管电泳 采样策略
• 年，卷（期）: 2024,（9）
• 页码范围: 181-197
• 页数: 17页
• 语种: 中文

摘要

利用SSR分子标记法，对青海、甘肃、四川和西藏自治区自然状态下的蕨麻进行了采样策略研究，旨在为后期蕨麻采样、育种等研究提供理论依据。试验样品采集设置为距离原点1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、40、50、60、80、90、100、120、150、160、200、250、300、400、500、1000、1500、2000、2500、5000、10000、15000、20000、30000、40000、50000 m处分别采样，后使用20对SSR引物对蕨麻6个居群210份样品DNA进行PCR扩增，通过毛细管电泳检测扩增片段大小，使用POPGENE、NTSYS、GenAIEx 6.5等软件进行分析，结果表明：1）遗传变异主要来源于居群内（变异方差分量和占比分比为12.745和84%），居群间变异较低（变异方差分量和占比分比为2.477和16%）;2)6个居群间遗传多样性较高，其中祁连县遗传多样性最高（平均杂合度H=0.2797，香农指数I=0.4287），河南县的遗传多样性最低（H=0.2273,I=0.3542）,6个居群整体遗传水平较高，表示在这6个居群间遗传变异低，采样时需要扩大范围；3）同一居群内采集蕨麻样品个体时，最短采样距离为5 km，有小型山脉时，跨越山脉即可采样。居群间采样分两种情况：1）具有离地面高度为1000～1500 m山脉时，翻越大型山脉后可直接采集蕨麻样本。2）在平原地区，由于花粉的长距离传播，居群间有基因交流，建议采样距离不小于100 km。