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紫花苜蓿GLK基因家族鉴定及渗透胁迫下的表达分析
紫花苜蓿GLK基因家族鉴定及渗透胁迫下的表达分析
作者:
马超
孙熙婧
冯雅岚
周爽
琚吉浩
吴毅
王添宁
郭彬彬
张均
.河南科技大学农学院
.武昌理工学院生命科学学院
原文服务方:
草业学报
紫花苜蓿;GLK基因;生物信息学;渗透胁迫;表达模式
摘要:
GLK (Golden2-like或G2-like)属于GARP超家族,是植物生长发育过程中的重要转录因子,在调节植物叶绿体发育、叶绿素生物合成和非生物胁迫响应等方面发挥着重要作用。目前,GLK基因家族成员已在多个物种中被系统鉴定,但在四倍体紫花苜蓿全基因组水平上仍然知之甚少。利用生物信息学的方法,在“新疆大叶”紫花苜蓿基因组中鉴定到100个GLK基因(MsGLKs),并对其理化性质、染色体定位、系统进化关系、启动子顺式作用元件以及渗透胁迫和外源脱落酸(ABA)处理下的表达模式进行了分析。结果显示,100个MsGLK基因在32条染色体上不均匀分布,蛋白序列长度为201~860个氨基酸。根据系统发育分析结果,将MsGLK家族成员分为13个组。共线性分析表明,在紫花苜蓿基因组中共发现193个MsGLK基因重复事件,基因非同义替代数/同义替代数(Ka/Ks)分析显示,大部分重复基因对经历了纯化选择。MsGLK基因启动子的顺式作用元件广泛参与了植物生长发育、激素响应和胁迫反应。基因表达数据显示,12个基因的表达具有组织特异性,25个基因在所有组织中表达。RT-qPCR检测发现,MsGLK基因在干旱胁迫、盐胁迫和外源ABA处理下均有一定程度的响应。研究结果将为进一步探索MsGLK基因的功能和紫花苜蓿抗逆性遗传改良提供参考。
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文献信息
篇名
紫花苜蓿GLK基因家族鉴定及渗透胁迫下的表达分析
来源期刊
草业学报
学科
农学
关键词
紫花苜蓿;GLK基因;生物信息学;渗透胁迫;表达模式
年,卷(期)
2025,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
174-190
页数
17页
分类号
字数
语种
中文
DOI
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
版权信息
全文
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参考文献(0)
二级参考文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
紫花苜蓿;GLK基因;生物信息学;渗透胁迫;表达模式
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
草业学报
主办单位:
中国草学会和兰州大学共同主办
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-5759
CN:
62-1105/S
开本:
出版地:
兰州市嘉峪关西路768号
邮发代号:
创刊时间:
1990-01-01
语种:
中文
出版文献量(篇)
145
总下载数(次)
0
总被引数(次)
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