摘要:

为了解山东地区犬细小病毒的流行及其变异情况,应用F81细胞从山东地区送检的发病犬粪便中分离出4株细小病毒,根据PCR和电镜技术对其进行鉴定,并对分离株的全基因组进行克隆测序与序列分析.结果表明:所分离到的4株病毒均能在F81细胞上产生明显的细胞病变,经PCR及电镜观察鉴定为犬细小病毒,分别命名为QN1/QN2/QN3/QN4株.全基因组分析结果显示,除QN3株的基因组全长为4 756 nt外,其余3株均为4 757 nt;4个分离株之间全序列核苷酸同源性为99.31％,与GenBank登录的10株具有代表性的CPV核苷酸序列比对,同源性为98.2％～99.9％; VP2基因的核苷酸序列同源性为98.5％～99.9％,氨基酸序列同源性为98.1％～100％;表明各分离毒株的亲缘关系较近,同属于New CPV-2a亚型.

摘要:

利用PK15细胞从临床发病猪和死亡猪淋巴结中分离到6株猪圆环病毒2型(PCV2),对其全基因组序列进行了测定和分析.结果表明,除深圳分离株(Sz)的基因组全长为1768 nt外,其余5株均为1767 nt;6个分离株之间全序列核苷酸同源性为98.08%;与欧、美毒株之间同源性高,介于94.4%～99.7%.

摘要:

目的:测定和分析我国登革2型病毒福建株(FJ-11)基因组非编码区(NCR)序列,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据.方法:从登革2型病毒感染的C6/36细胞中提取总RNA,采用RACE法扩增病毒基因组5′和3′端片段,分别将其克隆至pGEM-T载体,挑取阳性克隆进行序列测定;利用RNAdraw软件对非编码区二级结构进行预测.结果与结论:我国登革2型病毒FJ-11株基因组5′和3′非编码区长度分别为96?nt和454?nt,具有黄病毒共有的保守序列和二级结构.与登革2型病毒美洲基因型比较显示,5′NCR第69位核苷酸的改变对其二级结构有影响;3′NCR端约70?nt能形成相同的保守结构,而前380?nt呈现多处核苷酸的差异而导致两者预测的二级结构差别较大,它们可能对病毒基因组RNA的复制起重要作用.

摘要:

2011年冬对湖南环洞庭湖地区散养鸭群进行禽流感病毒(AIV)感染情况调查时从一鸭场环境粪便拭子中分离一株H12N7亚型AIV,命名为A/Environment/Hunan/S4484/2011 (H12N7),对其进行全基因序列测定及分析.结果显示该毒株HA基因裂解位点无多个连续的碱性氨基酸(PQAQDR↓ GLF),具有低致病性AIV的特征,对其全基因进行遗传进化分析表明8个基因片段来源非常复杂,与周边国家野禽中分离的毒株相似性很高,可能有共同的祖先来源,同时提示该毒株可能是不同亚型禽流感毒株之间基因交换所形成的重组体.

摘要:

为了解山东地区犬细小病毒的流行及其变异情况,应用F81细胞从山东地区送检的发病犬粪便中分离出4株细小病毒,根据PCR和电镜技术对其进行鉴定,并对分离株的全基因组进行克隆测序与序列分析.结果表明:所分离到的4株病毒均能在F81细胞上产生明显的细胞病变,经PCR及电镜观察鉴定为犬细小病毒,分别命名为QN1/QN2/QN3/QN4株.全基因组分析结果显示,除QN3株的基因组全长为4 756 nt外,其余3株均为4 757 nt;4个分离株之间全序列核苷酸同源性为99.31％,与GenBank登录的10株具有代表性的CPV核苷酸序列比对,同源性为98.2％～99.9％; VP2基因的核苷酸序列同源性为98.5％～99.9％,氨基酸序列同源性为98.1％～100％;表明各分离毒株的亲缘关系较近,同属于New CPV-2a亚型.

摘要:

目的测定和分析我国登革4型病毒广州(D4-B5)株基因组非编码区(NCR)序列,为探讨其结构特征与功能的关系提供依据.方法从登革4型病毒感染的乳鼠脑中提取总RNA,采用RACE法扩增病毒基因组5'和3'端片段,分别将其克隆至pGEM-T载体,挑取阳性克隆进行序列测定;利用RNAdraw软件对非编码区二级结构进行预测.结果与结论我国登革4型病毒广州株基因组5＇和3＇非编码区长度分别为101 nt和403 nt,具有黄病毒共有的保守序列和二级结构.与登革4型病毒多米尼加分离株比较显示,5＇NCR第57和36位核苷酸的改变对其二级结构有显著的影响;3＇NCR多处核苷酸差异导致两者预测的二级结构差别较大,但均能形成相同的保守结构,它们可能对病毒基因组RNA的复制、组装起重要作用.

摘要:

[目的]确定猪体内存在与猪圆环病毒2型核苷酸序列高度同源的因子.[方法]首先利用PCR方法对来自临床表现为猪断奶后多系统衰竭综合征的猪血清所抽提的DNA进行扩增,根据获得的序列再设计引物进行反向PCR,拼接得到类猪圆环病毒2型因子P1的全基因组序列,最后根据P1全基因组序列设计引物扩增其全基因组加以验证.[结果]首次完成了类猪圆环病毒2型因子P1的全基因组序列测定.测序结果表明P1因子为环状DNA基因组,全长648个核苷酸,包括3个开放阅读框.除5'端16个核苷酸外,P1因子与国内猪圆环病毒2型BF毒株的核苷酸同源率为98.42%.系统进化分析表明P1与猪圆环病毒有很近的亲缘关系.[结论]猪体内存在类猪圆环病毒2型因子P1.

摘要:

提取实验室保存禽副粘病毒-2标准毒株Yucaipa株和3株分离毒株F4、F6、F8株的RNA,经RT-PCR,获得4株毒株的HN基因,同时测得F基因与HN基因之间的序列.序列分析结果表明,HN基因的ORF全长为1 743 nt,编码一个由580个氨基酸组成的蛋白.运用DNAMAN软件分析,4株毒株与GenBank上已发表毒株的HN基因的核苷酸和氨基酸之间的同源性相比,同源率分别为99.89%和99.69%.分析F基因与HN基因间序列发现两基因间序列与副粘病毒科其他病毒的基因间序列相似,含有基因起始信号和终止信号,但不含3个碱基的连接序列.通过序列分析,在分子水平上进一步证实分离于同一批进口七彩文鸟的F4、F6株是抗原性存在差异的两个毒株.毒株间的血清学关系与分子水平的核苷酸序列、氨基酸序列的比较关系一致.

摘要:

在国内首次完成了猪繁殖与呼吸综合征病毒分离毒株的全基因组序列测定.用RT-PCR方法分段扩增出PRRSV北京地区分离株BJ-4株的2l条eDNA片段,分别克隆于pGEM-T-easy质粒载体并进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSV BJ-4株全基因组eDNA序列.测序结果表明PRRSV BJ-4株基因组全长15 504 b,包含8个开放阅读框,5′端有190nt先导序列;3′端有256ntUTR,其中包括95ntPoly(A)尾.PRRSVBJ-4株与美洲型毒株VR-2332和Nebreska的核苷酸同源率分别为99.5%和98.4%,而与欧洲型代表株LV株的核苷酸同源率为62.5%,与另一国内分离株CH-la株编码结构蛋白基因的核苷酸同源率为93.3%.