2813条全长人类新基因编码蛋白质的功能预测

• 作者: 付旭平 张雷 戴建凉 毛裕民 沈健民 田立峰 范俊 谢毅 马良宵 黄达蔷
• 来源期刊: 复旦学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 全长人类新基因 生物信息学 序列分析 功能预测
• 年，卷（期）: 2000,（6）
• 页码范围: 639-644
• 页数: 6页
• 分类号: Q332
• 字数: 4491字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0427-7104.2000.06.012

摘要

用生物信息学序列分析方法对联合基因科技(集团)公司2813条全长人类新基因编码的蛋白质进行了功能预测.由WU-BLASTP核酸序列相似性分析结果表明P值小于le-20的基因合计有466条,占总分析基因的16.57%,P值在le-10以下的基因合计有565条,占总分析基因的20.09%;由蛋白质结构域分析结果表明,含PROSITE pattern的基因有520条,代表了107种pattern;含PROSITE profile的基因有333条,代表了200种profile;含PFAM结构域的基因有457条,代表了241个family;含PRINTS的家族指纹1型(class1)的基因有128条,指纹2型(class2)的有18条,总数为146条,代表了45种家族指纹;由特殊结构分析表明,跨膜蛋白470条,分泌蛋白677条,Coiled-coil蛋白228条,Helix-turn-helix蛋白73条.