孙女设计中标记密度对QTL定位精确性的影响

• 作者: 张勤 张沅 王菁
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 标记密度 QTL定位 最小二乘法 孙女设计
• 年，卷（期）: 2000,（7）
• 页码范围: 590-598
• 页数: 9页
• 分类号: Q98
• 字数: 5322字
• 语种: 中文

摘要

采用蒙特卡罗方法分析了在孙女设计中不同的群体结构、性状遗传力、QTL效应大小和QTL在染色体上的位置等各个因素不同水平组合下4种标记密度（标记间隔5cM，10cM，20cM和50cM）对QTL定位精确性（以均方误MSE为衡量指标）的影响，并从经济学角度探讨了应用 于标记辅助选择（MAS）的QTL定位的最佳标记密度。结果表明，一般说来，在各因素水平都较低时，MSE随标记密度加大而下降的相对幅度也较小；反之，在各因素的水平都较高时，MSE随标记密度加大而下降的相对幅度也较大。当样本含量达到一定水平时（如40个家系，每个家系100个儿子），或当QTL效应达到一个较高水平时（如QTL方差占加性遗传方差的50%），MSE随标记密度加大而下降的幅度几乎不受其他因素的影响，始终保持一个较高的水平（95%左右）。对于MAS可获得的最佳经济效益来说，在不同的各因素水平组合下QTL定位的最佳标记间隔分别为5cM（小样本、大QTL，或中等样本、中等遗传力和QTL，或大样本、小QTL）、10cM（中等样本、高遗传力或大QTL，或大样本、中等遗传力和QTL）和20cM（大样本、高遗传力或大QTL）。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张勤	中国农业大学动物科技学院	89	1003	18.0	29.0
2	张沅	中国农业大学动物科技学院	110	1282	19.0	28.0
3	王菁	中国农业大学动物科技学院	2	21	1.0	2.0