分子对接的随机聚点搜索算法

• 作者: 张有广 李炜疆
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 随机聚点搜索算法 刚性分子对接 全局极小化
• 年，卷（期）: 2001,（1）
• 页码范围: 181-186
• 页数: 6页
• 分类号: Q617
• 字数: 4267字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2001.01.024

摘要

随机聚点搜索算法是一种普遍的全局极小化方法，在目标函数自变量数目不很大时，计算效率较高。将该算法应用于分子对接，首先要通过模型分子对接，反复调整算法各控制参数使效率最高。对于HIV－1蛋白酶与苯甲醚配体的刚性对接，算法成功的找到了相互作用能量全局极小，与晶体结构的均方根偏差(RMSD)仅0.2?。这表明，该算法可高效率找到分子对接的能量最适构型。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李炜疆	无锡轻工大学生物工程学院	4	19	3.0	4.0
2	张有广	内蒙古大学理论物理与理论生物学研究室	4	14	2.0	3.0