中日产川芎的matK、ITS基因序列及其物种间的亲缘关系

• 作者: 伏见裕利 刘玉萍 小松かつ子 曹晖 韩桂茹
• 来源期刊: 药学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 川芎 日本川芎 matK基因 ITS基因 核苷酸测序
• 年，卷（期）: 2002,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 63-68
• 页数: 6页
• 分类号: R282.5
• 字数: 4272字
• 语种: 英文
• DOI: 10.3321/j.issn:0513-4870.2002.01.015

摘要

目的分析中国产川芎Ligusticum chuanxiong Hort.及日本产川芎Cnidium officinale Makino的核基因组ITS和叶绿体基因组matK序列,为探讨中日产川芎物种间的亲缘关系提供分子依据.方法采用PCR直接测序技术测定川芎和日本川芎的ITS基因和matK基因核苷酸序列并作序列变异分析.结果川芎和日本川芎的matK序列长度均为1268 bp,编码422个氨基酸.ITS1-5.8S-ITS2序列长度均为699 bp,其中18S rRNA基因3′端序列54 bp,ITS1序列215 bp,5.8S rRNA基因序列162 bp,ITS2序列222 bp,26S rRNA基因5′端序列46 bp.根据排序比较,川芎原植物与其商品药材间的matK基因和ITS基因序列完全相同,而川芎与日本川芎间matK基因则仅有1个变异位点,即在上游959 nt处1个转换替代(T→C),反映在氨基酸序列则发生一个非同义取代V(GTG)→A(GCG);ITS基因也仅有1个变异位点,即在ITS1上游54 nt处1个转换替代(T→C).结论通过进化速率较快的基因序列同源性分析,基本可以认为中日所产川芎基原一致,日本川芎学名似应改为Ligusticum chuanxiong Hort..

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩桂茹		55	310	9.0	14.0
2	曹晖		33	527	10.0	22.0
3	刘玉萍	中国中医研究院中药研究所	14	589	11.0	14.0