人类新基因C17orf32的电子克隆和编码区序列RT-PCR验证

• 作者: 丁培国 凌伦奖 张德礼 陈润生 马大龙
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 生物学
• 关键词: C17orf32 LOC124919 XM-058865 XP-058865 生物信息学 电子克隆 RT-PCR 人类基因组注释
• 年，卷（期）: 2002,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 543-549
• 页数: 7页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3469字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-3282.2002.04.011

摘要

利用生物信息学与实验验证的技术路线,成功地克隆了人类新基因C17orf32的cDNA(GenBank登记号:AY074907和TPA: BK000260),发现C17orf32的完整开放阅读框架(ORF,31～657 bp)cDNA(627 bp)与人类假定基因LOC124919 ORF(25～807 bp)的25～651位只有一个碱基不同.经RT-PCR验证并cDNA测序、人类表达序列标签(EST)数据库的BLAST检索和基因组成规律分析三方面的结果,均支持C17orf32的序列,而不支持LOC124919的编码序列.C17orf32基因组序列全长4.610 kb,含有6个外显子和5个内含子,cDNA序列全长1 679 bp, ORF横跨全部6个外显子.该基因ORF翻译起始处符合Kozak规则,ORF起始码上游同一相位有终止码,ORF后有2个加尾信号和PolyA尾.C17orf32基因的成功克隆表明,NCBI GENOME Annotation Project在2001年12月预测的人类假定蛋白XP-058865编码基因LOC124919的模式参考序列XM-058865中存在偏差,即在C17orf32基因cDNA的406与407位碱基之间错误插入一个碱基G, 从而导致在插入位点后,ORF编码125位氨基酸以后蛋白质序列的改变,出现260个氨基酸的多肽.因此,应慎重看待计算机注释的人类基因组编码序列.建立的技术路线有助于发现更多新的人类功能基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马大龙	北京大学人类疾病基因研究中心国家人类基因组北方研究中心	71	944	16.0	28.0
2	陈润生	中国科学院生物物理研究所	33	413	10.0	20.0
3	张德礼	北京大学人类疾病基因研究中心国家人类基因组北方研究中心	5	149	4.0	5.0
4	凌伦奖	中国科学院生物物理研究所	7	154	5.0	7.0
5	丁培国	北京大学人类疾病基因研究中心国家人类基因组北方研究中心	1	54	1.0	1.0