幽门螺杆菌黏附素AlpA保守区基因的克隆、序列测定及其生物信息学分析

• 作者: 但汉雷 周殿元 张亚历 张兆山 林焕健 王继德 白杨
• 来源期刊: 细胞与分子免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 黏附素 序列分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2002,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 543-545
• 页数: 3页
• 分类号: R378.99
• 字数: 2104字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1007-8738.2002.06.008

摘要

目的克隆幽门螺杆菌(Helicobacter pylori, Hp)4种黏附素(babA、alpA、alpB和hopZ)基因的保守区, 并对其进行序列及生物信息学分析.方法利用ANTHEPROT V4.3c 软件, 分析已证实的Hp 4种黏附素蛋白序列, 发现4种黏附素的C-端氨基酸存在保守区. 选取AlpA的C-端结构基因序列作为引物进行PCR, 将PCR产物定向插入载体pET-22b(+), 以DNA自动分析仪进行序列测定, 并以生物信息学软件分析其生物学特性.结果克隆片段的长度为588 bp, 与发表的黏附素AlpA保守区基因的序列完全一致.ANTHEPROT V4.3c软件预测其蛋白质的Mr约为22 500, 并显示出良好的抗原性和疏水性.结论用PCR方法, 从幽门螺杆菌ss1中获取到黏附素AlpA保守区的基因序列, 为研究Hp黏附素的分子机制和免疫原性奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王继德	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	48	513	14.0	21.0
2	周殿元	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	93	1090	21.0	29.0
3	张亚历	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	115	1279	21.0	30.0
4	张兆山	军事医学科学院生物工程研究所	83	560	14.0	19.0
5	白杨	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	31	265	9.0	15.0
6	但汉雷	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	12	164	5.0	12.0
7	林焕健	第一军医大学南方医院全军消化病研究所	2	22	1.0	2.0