杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 周厚君 彭沙沙 时剑 林二培 童再康 黄华宏
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 林木育种学 杉木 纤维素合成酶类似蛋白 克隆 表达
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 1-6
• 分类号: S722.1|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-0756.2012.01.001

摘要

纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区.利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RTPCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列.应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因.多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71％以上.利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	童再康	浙江农林大学林业与生物技术学院	36	168	6.0	11.0
2	黄华宏	浙江农林大学林业与生物技术学院	21	83	6.0	7.0
3	林二培	浙江农林大学林业与生物技术学院	15	60	6.0	7.0
4	周厚君	浙江农林大学林业与生物技术学院	4	23	3.0	4.0
5	时剑	浙江农林大学林业与生物技术学院	2	16	2.0	2.0
6	彭沙沙	浙江农林大学林业与生物技术学院	2	6	1.0	2.0